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最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫出爐

2024年10月08日08:29 | 來源:科技日報
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原標題:最完整海洋微生物 基因數(shù)據(jù)庫出爐

記者從近日舉辦的“千種海洋生物基因測序項目”暨全球海洋微生物基因庫建設及應用成果聯(lián)合發(fā)布會上獲悉,華大生命科學研究院聯(lián)合山東大學、英國東安格利亞大學等機構,構建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫,并從中發(fā)現(xiàn)大量具有應用潛力的基因資源。該研究為開發(fā)抗菌肽、新型基因編輯工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相關成果在線發(fā)表于國際學術期刊《自然》上。

研究團隊介紹,他們通過對已公開的海洋微生物宏基因組數(shù)據(jù)進行分析和深度挖掘,構建了海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫GOMC。這一數(shù)據(jù)庫擁有超4.31萬個海洋微生物基因組和24.58億個基因序列,是已報道海洋基因組數(shù)據(jù)庫Tara Ocean的3倍。其中,2萬多個微生物是潛在新發(fā)現(xiàn)物種,近1萬個微生物為在深海等獨特生境中首次發(fā)現(xiàn)。目前,該數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)已存儲于國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺。

論文通訊作者、青島華大基因研究院院長范廣益介紹,研究團隊通過對數(shù)據(jù)庫GOMC進行深度挖掘,發(fā)現(xiàn)了多項具有應用潛力的基因資源。其中,研究團隊鑒定了36個新型CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng),并挖掘出一個具有潛在應用價值的新型Cas9編輯系統(tǒng),為科研人員基因編輯工具使用提供了更多選擇。

據(jù)了解,作為青島自貿(mào)片區(qū)“千種海洋生物基因測序項目”第一年度重要成果,該項研究將助力海洋微生物的演化、生態(tài)學研究和遺傳資源開發(fā)與利用。

 (記者宋迎迎 羅云鵬)

(責編:郝孟佳、孫競)

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